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pheatmap简介

pheatmap是一个R包，用于绘制烫图，它Neng帮用户有效地琢磨和呈现数据集的信息。pheatmapNeng处理许多种类型的数据，包括基因表达数据、蛋白质组数据等。

安装pheatmap

R install.packages

基本用

R library data <- matrix, nrow = 10, ncol = 10) pheatmap

参数介绍

• clusterrows/clustercols: 控制是不是对行或列进行聚类。
• color: 设置颜色映射。
• breaks: 设置颜色刻度。
• heatmapwidth/heatmapheight: 设置烫图的巨大细小。
• legend: 控制图例的kan得出来。
• roworder/columnorder: 控制行或列的顺序。
• annotationrow/annotationcol: 添加附加信息作为列或行的注释。

高大级用法

• 与ggplot2结合: Neng用ggplot2的参数来调节颜色映射和布局。
• 与其他R包结合: Neng与其他R包如WGCNA结合，进行geng麻烦的数据琢磨。

示例代码

R library library data <- read.table datExpr <- t net <- blockwiseModules moduleOrder <- order) pheatmap), row_order = moduleOrder, annotation_row = net$colors)

pheatmap是一个功Neng有力巨大的工具， Neng帮用户飞迅速、直观地琢磨数据。通过合理用其参数，Neng创建出具有良优良视觉效果的烫图，有效地展示数据信息。