Cellpose掩码图像为何全黑？如何解决？

哎哟我的天！Cellpose生成的掩码怎么又是全黑的？心态崩了啊！

我开心到飞起。 说实话，我真的快崩溃了。搞生物图像分析的兄弟姐妹们，你们懂那种感觉吗？辛辛苦苦跑了一晚上的数据， 满心欢喜地以为第二天早上起来能看到漂亮的细胞分割后来啊，后来啊一点开那个生成的掩码图像——好家伙，全黑！一片漆黑！就像我的心情一样，也像那个没有星星的夜晚。我当时就在想，是不是我的显卡炸了？还是说Cellpose这个软件其实是在跟我开玩笑？这哪里是细胞分割，这简直是分割我的快乐啊！

后来我才发现，原来这事儿吧，还真不全是软件的锅。虽然Cellpose是个好东西， 它是基于深度学习的开源软件，专门搞细胞分割的，号称“通用”，能处理各种各样的细胞，不管你是贴壁的还是悬浮的，它都能给你整出点花样来。 白嫖。 但是这掩码图像显示全黑的问题，真的是太搞人心态了。我查了半天资料，喝了三杯咖啡，才稍微理出点头绪。今天我就要把这个破事儿给说清楚，顺便发发牢骚，希望能帮到那些还在对着黑屏发呆的朋友们。

这到底是为什么？难道是我的电脑瞎了？

先说说我们要明白一个道理，眼见不一定为实。你以为那是全黑，其实那是“富贵不能淫，贫贱不能移”的数据。Cellpose生成的掩码图像，它根本不是普通的RGB图片，它是个16位无符号整数格式！这是什么意思呢？简单 普通图片查看器，比如你Windows自带的那个照片查看器，或者某些简陋的看图软件，它们脑子比较简单，它们只认得8位的数据。当你给它们看一个16位的图， 而且里面的数值可能只有0、1、2、3...或者几百几千的时候，这些查看器就懵了。

它们会想：“哎呀，这数值怎么这么小？或者这数值怎么这么大？不管了反正我也显示不出来干脆全给你涂黑吧！”于是你就看到了一片黑。其实数据都在那里好端端地躺着呢，只是被显示方式给“埋没”了。 嗯，就这么回事儿。 这就好比你有一肚子学问，但是你表达能力差，别人就以为你是个傻子，这冤不冤？冤！太冤了！ENVI默认将0值显示为黑色，1值显示为白色，这还算有点良心，但很多软件连这点面子都不给。